Store molekyler har brug for mere hjælp til at rejse gennem en kernepore ind i cellekernen

Store molekyler har brug for mere hjælp til at rejse gennem en kernepore ind i cellekernen
Store molekyler har brug for mere hjælp til at rejse gennem en kernepore ind i cellekernen
Anonim

En ny undersøgelse inden for biofysik har afsløret, hvordan store molekyler er i stand til at trænge ind i en celles kerne. Et hold ledet af professor Edward Lemke fra Johannes Gutenberg University Mainz (JGU) har således givet vigtig indsigt i, hvordan nogle vira for eksempel kan trænge ind i cellekernen, hvor de kan fortsætte med at formere sig og inficere andre. De har også påvist, at effektiviteten af transport ind i en celle falder, når størrelsen af molekylerne øges, og hvordan tilsvarende signaler på overfladen kan kompensere for dette.

"Vi har været i stand til at opnå ny forståelse for transport af store biostrukturer, hvilket hjalp os med at udvikle en simpel model, der beskriver, hvordan dette virker," sagde Lemke, specialist inden for biofysisk kemi. Han er professor i syntetisk biofysik ved JGU og adjungeret direktør for Institute of Molecular Biology (IMB) i Mainz.

Nuklear lokaliseringssignaler letter hurtig adgang

En typisk pattedyrcelle har omkring 2.000 nukleare porer, som fungerer som passager fra cellecytoplasmaet ind i cellekernen og omvendt. Disse porer i den nukleare kappe fungerer som gatekeepere, der kontrollerer adgang og nægter adgang til større molekyler på omkring fem nanometer i diameter og større. Molekyler, der har bestemte nukleare lokaliseringssekvenser på deres overflade, kan binde sig til strukturer i nukleare porer, hvilket gør det muligt for dem at trænge ind i kernen hurtigt. "Atomporer er bemærkelsesværdige i den mangfoldighed af laster, de kan transportere. De importerer proteiner og vira ind i kernen og eksporterer ribonukleinsyrer og proteiner til cellecytoplasmaet," forklarede Lemke og beskrev funktionen af disse porer. "På trods af processens fundamentale biologiske relevans har det altid været en gåde, hvor store ladninger større end 15 nanometer transporteres effektivt, især i lyset af dimensionerne og strukturerne af selve nukleare porer."

Med dette sind og som en del af deres projekt designede forskerne et sæt store modeltransportgods. Disse var baseret på capsider, dvs. protein-"skaller" i vira, der omslutter det virale genom. Lastmodellerne med en diameter på mellem 17 og 36 nanometer blev derefter fluorescerende mærket, så de kunne observeres på vej gennem celler. Capsidmodeller uden nukleare lokaliseringssignaler på deres overflade forblev i cellecytoplasmaet og kom ikke ind i cellekernen. Efterhånden som antallet af nukleare lokaliseringssignaler steg, blev akkumuleringen af modelkapsid i kernen mere effektiv. Men endnu mere interessant fandt forskerne ud af, at jo større kapsid, jo større var antallet af nukleare lokaliseringssignaler, der var nødvendige for at muliggøre effektiv transport ind i kernen.

Forskerholdet undersøgte en række capsider af forskellige vira, herunder hepatitis B-capsiden, den største last, der blev brugt i denne undersøgelse. Men selv at øge antallet af nukleare lokaliseringssignaler til 240 resulterede ikke i transporten af dette capsid ind i kernen. Dette svarer til resultaterne af tidligere undersøgelser af hepatitis B-virus, der har indikeret, at kun den modne infektiøse virus er i stand til at passere gennem en nuklear pore ind i kernen.

Samarbejde muliggjorde udviklingen af en matematisk model

I samarbejde med professor Anton Zilman fra University of Toronto i Canada blev der udviklet en matematisk model for at kaste lys over transportmekanismen og etablere de vigtigste faktorer, der bestemmer transportens effektivitet."Vores simple biofysiske model med to parametre har genskabt kravene til nuklear transport og afsløret vigtige molekylære determinanter for transporten af store biologiske laster på celler," konkluderede førsteforfatter Giulia Paci, der udførte undersøgelsen som en del af sin ph.d.-afhandling på European Molecular Biology Laboratory (EMBL) i Heidelberg.

Populært emne.